2 năm đã trôi qua kể từ ngày chương trình Treadstone đổ bể, Jason Bourne mai danh ẩn tích sống hạnh phúc cùng bạn gái xinh đẹp Marie. Anh chỉ mang máng nhớ mình là một điệp viên CIA. Thỉnh thoảng những hình ảnh kinh hoàng lại hiện về trong trí óc trong phim hay này nhưng Jason không thể hồi tưởng chi tiết cụ thể những gì đã diễn ra…

Trên đường phố đông đúc, phát hiện bị theo dõi, một khuôn mặt làm Jason gợi nhớ về dự án Treadstone mà anh từng tham gia. Linh cảm nguy hiểm cận kề, anh cùng Marie tìm đường lẩn trốn. Không may trong cuộc truy sát, bạn gái anh đã vĩnh viễn ra đi, Jason thoát chết nhưng phải lặn biệt tăm. Nuốt nỗi đau vào lòng, tiêu hủy giấy tờ hình ảnh, bay về Châu Âu, anh quyết tâm đi tìm sự thật.