Phù Thủy Trong Gương lấy cảm hứng từ cuốn sách Dongui Bogam của thần y Heo Joon thời Joseon, được xem là tư liệu quý giá đối với y học truyền thống Hàn Quốc. Hoàng hậu Shim (Jang Hee Jin) vì không thể có con, đã tới gặp pháp sư Hong Joo (Yeom Jung Ah). Hong Joo dùng pháp thuật ma quái của mình giúp Hoàng hậu sinh được cặp song sinh một trai một gái, Soon Hwae (Yeo Hoe Hyun) và Seo Ri (Kim Sae Ron). Thế nhưng, cái giá phải trả cho việc sử dụng năng lực tà ma chính là công chúa Seo Ri bị nguyền rủa. Seo Ri bị chính mẹ đẻ bỏ rơi tới chết, nhưng may mắn được cứu thoát bởi cha của Poong Yeon (Kwak Shi Yang), người bạn duy nhất của cô sau này. Cùng với Poong Yeon và người hầu Choi Hyun Seo (Lee Sung Jae), Seo Ri trở thành phù thủy với quyết tâm tìm ra cách hóa giải lời nguyền cho chính mình. Gặp được thần y Heo Joon (Yoon Shi Joon), liệu anh ta có thể thay đổi số mệnh của cô và giúp cô trở lại vị trí vốn có của mình?